Znalosti chování membránových proteinů jsou zásadní pro pochopení buněčné biologie eukaryontů. Nyní se ukazuje, že informace o proteinech s neznámou funkcí lze získat z identifikace jejich interakcí s proteiny se známou funkcí. Hydrofobní povaha komplexů membránových proteinů lze podle nových zjištění popsat pomocí afinitní purifikace v přítomnosti nedenaturujících detergentů. Dojde tak k spolupurifikaci proteinů hmotovou spektrometrií a je možno tak pořídit rozsáhlou mapu fyzikálních interakcí membránových proteinů.