Jak už jméno vytvořené podle vzoru cyklotron či synchrotron naznačuje, jde o zařízení určené k sledování pochodů v oblasti rostlinných kořenů. Největší a nejuniverzálnější rhizotron byl vybudován v Houghtonu ve státě Michigan za půl milionu dolarů a obsahuje 24 odkrývatelných komor, v nichž lze regulovat teplotu, vlhkost, tlak a do nichž lze vnášet různé sloučeniny s potenciálním účinkem na rostlinné kořeny. Jsou tu přítomny různé druhy hmyzu, červů atp., jako je tomu v přírodě. Motivace k této činnosti pramení z obav z globálního oteplování, emisí oxidu uhličitého a dalších jevů, potenciálně vedoucích k vymírání živočišných i rostlinných druhů.