Regulační protein zvaný ubikvitin označuje různé další proteiny určené k destrukci. Jak je možné, že se váže na tak rozmanité substráty? Je to prý tím, že se pohybuje mezi různými strukturami, dokud nenajde tu vhodnou, říkají pracocvníci Max-Planckova ústavu v Göttingen. Čtyřicetšest struktur bylo známo z rentgenové krystalografie komplexů zachycujících ubikvitin. Podrobný výzkum v této oblasti pikosekund až mikrosekund ukázal, že se všechny struktury vyskytují v živých buňkách. Je zřejmé, že mnoho konformací daného proteinu může existovat v dynamické rovnováze, než se dostaví vazebný partner. Tato představa je ovšem v rozporu s klasickou hypotézou enzymové kinetiky o indukované podobnosti (induced fit).
Jak pozná ubikvitin svoji oběť?
20.7.2008
