Většina proteinů je transportována z bakterií pomocí cytoplasmatické adenosintrifosfatázy označené SecA, která interaguje s membránovým kanálem tvořeným heterotrimerním komplexem SecY. Pracovníci z Harvardovy lékkařské fakulty v Bostonu nyní popsali detailní krystalickou strukturu SecA navázaného na SecY s maximálním rozlišením 0,45 nanometru, a to s proteiny z bakterie Thermotoga maritima z řádu Thermotogales. Jedna kopie SecA v přechodném stadiu hydrolýzy ATP se váže na komplex SecY a polypeptidová křížová doména SecA projde velkou konformační změnou, kterou se zachytí přenášený polypeptid. Jeho pohyb kanálem SecY probíhá jakýmsi prstem v SecA v cytoplasmatickém trychtýři SecY a koordinovaným zužováním a rozšiřováním úchytu SecA v póru SecY. Vazba SecA pak vytvoří jakési okno v postranní brance kanálu SecY a odstraní zátkovou doménu, čímž se připraví kanál pro vazbu signální sekvence a vlastní otevření.
Struktura translokačního kanálu pro proteiny
8.11.2008
